Debido a que la Ciencia Cristiana parece divergir radicalmente de la teología convencional, algunas veces es criticada por quienes no la comprenden. Tal vez nadie escribió tan duramente en contra de la Sra. Eddy como Mark Twain (Samuel Clemens). No obstante, dijo a su biógrafo, Albert Bigelow Paine: “La Ciencia Cristiana es una bendición para la humanidad... Ella [la Sra. Eddy] es la benefactora del siglo”. Citado en el libro de Robert Peel, Mary Baker Eddy: The Years of Authority (New York: Holt, Rinehart and Winston, 1977), pág. 205;
La autoridad que gobierna la Iglesia fundada por la Sra. Eddy, no es una persona o una jerarquía sino su libro el Manual de La Iglesia Madre. Este libro establece a La Junta Directiva de la Ciencia Cristiana de La Primera Iglesia de Cristo, Científico, en Boston, Massachusetts. Pero la autoridad permanece en el Manual, el cual constituye la organización y operación de la iglesia. El Manual estipula que: “Cada Iglesia de Cristo, Científico, tendrá su propia forma de gobierno”.Man., Art. XXIII, Sec. 1; Además estipula: “En la Ciencia Cristiana cada iglesia filial será netamente democrática en su forma de gobierno, y ninguna persona ni otra iglesia deberá intervenir en sus asuntos”.ibid., Art. XXIII, Sec. 10;
En la Iglesia de Cristo, Científico, no hay un ministro ordenado. En su lugar, dos Lectores laicos, a menudo un hombre y una mujer, leen la Lección-Sermón semanal del Cuaderno Trimestral de la Ciencia Cristiana. Uno de los Lectores lee de la Biblia (Versión Reina Valera) y el otro lee pasajes de Ciencia y Salud por la Sra. Eddy los cuales aclaran el significado espiritual de las Escrituras. Estos dos libros son el pastor. Para los Científicos Cristianos estos libros, así como los otros escritos de la Sra. Eddy, son sus únicos libros de texto para aprender Ciencia Cristiana.
